本发明提出一种管线焊缝缺陷处理方法，包括以下步骤：步骤1：对焊缝进行无损探伤；步骤2：根据缺陷的位置为焊缝内部或外表面处的缺陷还是焊缝根部的缺陷，确定形成的坡口的形式；步骤3：根据所形成的坡口的形成确定焊接方法，对焊缝进行焊接；步骤4：焊接完成后，对焊接接头进行焊后热处理。采用本发明的方法可以对质材上的焊缝缺陷进行直接焊接返修，可不必追求100%的一次焊接合格率，降低了过程控制要求，且可免除热处理前的探伤工作，并在发生缺陷后避免更换管件，这将大大的降低生产成本。