本发明公开一种用于治疗便秘的药物组合物及其应用，其在于该组合物的有效成分包含由枯草杆菌、嗜酸乳杆菌和保加利亚乳杆菌组成的混合益生菌菌剂、水溶性膳食纤维和谷氨酰胺，按质量份计，各有效成分的用量为：混合益生菌菌剂1~3份、水溶性膳食纤维10~30份、谷氨酰胺10~20份。本发明的组合物具有柔软粪便、促进肠蠕动、恢复肠道菌群平衡、修复受损肠粘膜等功效，恢复肠道正常生理功能，从根本上治疗便秘。且组合物中的成分发挥各自的作用缓解便秘症状，并相互促进、相互协同，加强疗效，其使用效果明显好于各组份的单独使用。