本发明公开了一种碱性复合离子液体及生物柴油制备方法，碱性复合离子液体包括质量比按1：0.05～1：0.4组配的N－R－N－甲基咪唑氢氧化物和醇钠；方法使用该碱性复合离子液体制备生物柴油，包括生物油脂预处理、酯交换反应、产物分离、吸附、过滤等步骤。本发明制备的生物柴油产品磷含量、一价金属（K＋Na）含量、二价金属（Ca＋Mg）等达到欧洲、美国标准，具有离子液体合成简单，成本低，对设备腐蚀性低，可以循环使用，催化效率高，适用范围广；方法工艺简单，生物柴油转化率高、产率高；反应直接分离得到生物柴油成品，不需水洗、蒸馏，生产效率高，能耗低；油脂不发生皂化，产物分离简单、产品纯度及产率高并，同时更加环保等优点。