本发明公开了一种水平井底水封堵堵剂体系以及底水封堵工艺，其特征在于：对于常规水平井所述底水封堵剂体系由无机沉淀型体系和聚硅体系或聚合物冻胶体系组成；对于热采水平井，所述底水封堵剂由无机沉淀型体系和N2泡沫体系或温敏凝胶体系组成。所述的水平井底水底水封堵工艺，包括以下步骤：(1)在明确出水点的基础上，使用机械封隔器注入环空化学封隔器，以保证注入的选择性；(2)根据水平井所处油藏的温度、非均质性参数选择堵剂体系；(3)堵剂体系的注入。本发明堵剂体系选择合理、组合得当、可注性强，该工艺技术应用于高含水或特高含水水平井后，可以达到高强度深部封堵的目的，封堵率90％以上，有效的降低水平井含水率，提高油井产能。