一种测定堆肥样品中生物有效态重金属含量的方法，其主要步骤为：A)将堆肥样品加入不同比例的纯水，分别将上清液过滤，收集滤液，得到一系列不同加水量的滤液；B)将薄膜扩散梯度装置分别放入各滤液中，置于磁力搅拌器上进行吸附反应，取出薄膜扩散梯度装置的结合相，加入HNO3溶液，使结合相全部浸没；浸提后测定溶液中重金属浓度；C)计算结合相和薄膜扩散梯度装置中累积的重金属浓度。本发明具有精确度高、重复稳定性好的特点，对天然降雨状态下堆肥样品中生物有效态重金属浓度可以准确定量分析。