本发明公开了一种基于模块化能量控制的燃气轮机控制系统，属于燃气轮机控制领域，该系统包括微型燃气轮机、功率控制模块和燃料控制分系统；燃料控制分系统包括燃料控制模块和燃料细分设备；不同燃料类型的燃料控制分系统中，燃料控制模块和燃料细分设备的器件不同。功率控制模块进行如下计算：根据实际功率、给定功率计算给定转速；根据实际转速、给定转速计算给定排温；根据给定排温、实际排温计算给定能量；根据给定能量和燃料热值计算所需燃料量。功率控制模块将通过以上计算确定燃料控制指令发送到燃料控制模块，燃料控制模块根据指令进行相应控制。本发明根据能量决定燃料量，可实现燃料的低排放燃烧，适用于燃气轮机的燃烧控制。