一种基于电子航道图及水位数据的航道水深信息生成方法：设置电子航道图上水深点的基准面信息；根据沿江水位站发布的实测与预测水位信息，结合电子航道图的基准面信息对水深值进行动态修正，得到绝对水深值；根据绝对水深值，提取等深线；根据等深线的深度区间，计算指定深度的可航水深区域和动态中心线，并通过WebService发布所生成的水深信息。根据本发明技术方案，基于长江电子航道图系统中的公共服务平台、网络通讯环境和船用终端应用系统，可实现定时计算长江干线航道水深信息，并以数据服务的方式提供给船用终端应用系统使用。