本发明涉及一种来自“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢参与二十二碳六烯辅酶A出发合成代谢二十二碳六烯酸的十六烷辅酶A水解酶，编码这个酶的基因及其应用。所述十六烷辅酶A水解酶氨基酸序列与SEQ ID No.1或SEQ ID No.3所示序列具有90%以上同源性。本发明从原理上对二十二碳六烯辅酶A合成二十二碳六烯酸的代谢途径进行了详细研究，包含本发明所提供的核苷酸序列的克隆DNA可以用来通过转导、转化、结合转移的方法转入工程菌中，通过调节二十二碳六烯酸生物合成基因的表达，赋予宿主十六烷辅酶A水解酶的高表达性，为扩大二十二碳六烯酸的产量提供了有效途径，具有重大应用前景。