本发明涉及一种内部关联交易业务的自动识别和提取方法及系统，其方法包括以下步骤：内部关联交易业务的特征规则库建立步骤，用于在财务管理信息系统中建立统一的内部关联交易业务的特征规则库，以供交易业务发生时判断处理使用；内部关联交易业务的自动识别和提取步骤，用于财务管理信息系统在业务发生时，根据所述内部关联交易业务特征规则库，自动识别出交易业务中的内部关联交易业务并进行记录提取；其系统包括内部关联交易业务的特征规则库单元及内部关联交易业务的自动识别和提取单元。本发明的内部关联交易业务的自动识别和提取方法及系统实时、准确地将内部关联交易业务自动识别并提取到集团统一的内部交易业务对账平台供后续应用。