本发明公开了一种烟丝装箱系统，卸料斗装置的底部设置直卸料口(11)和缓存卸料口(12)；当烟丝重量未达到设定阈值时，烟丝通过直卸料口(11)落在布料输送带(4)上；当烟丝重量达到设定阈值时，烟丝通过缓存卸料口(12)落至缓存输送带(9)上；当空的烟丝箱(7)更换后，烟丝通过直卸料(11)落在布料输送带(4)上，并且，缓存输送带(9)上的烟丝落在布料输送带(4)上，装箱装置将布料输送带(4)上的烟丝装入烟丝箱(7)中。本发明的烟丝装箱系统，为一种单头装箱系统，满足小流量烟丝在线装箱，实现了烟丝自动化不间断装箱，提高设备运行效率，并有效降低了设备投资，使得生产线的空间使用效率更高。