本发明公开了一种控制鱼类生殖的方法，其步骤：A，构建重组基因CMV-eGFP-SV40-CMV-Gal4-SV40，建立转GAL4基因斑马鱼家系；B，构建重组基因CMV-RFP-SV40-UAS-antisense dnd，建立转uas-antisense dnd基因斑马鱼家系；C，以两个家系的转基因鱼纯合子为亲本杂交，杂交后代鱼生殖败育。本发明通过两系可育而杂交子代诱导不育的策略，建立了一种具有普遍意义的控制鱼类育性的新方法。该方法解决了生殖操作研究中鱼的不育性与性状的可遗传性间的矛盾，能有效运用于鱼类新品种培育和种群控制。