本发明涉及一种磷酸钙/有机物复合纳米颗粒的制备方法，包括：将溶解有阳离子聚电解质和可溶性磷酸盐的水溶液A，和溶解有阴离子聚电解质和可溶性钙盐的水溶液B混合搅拌；以及将所得沉淀分离、洗涤和干燥得到所述磷酸钙/有机物复合纳米颗粒。本发明以可溶性钙盐和可溶性磷酸盐为钙源和磷源，原料来源方便易得、廉价，采用带有相反电荷的聚电解质高分子作为调控剂，通过自组装的方法合成了磷酸钙/有机物复合纳米颗粒。所制备的磷酸钙/有机物复合纳米颗粒具有尺寸小、尺寸分布均匀和胶体稳定性好等特点。