本发明公开了一种卫星在轨大规模程序修改的自动验证系统，针对在轨大规模程序修改量大，人工比对效率低、可靠性低的问题分析，本发明提出了一种在轨大规模程序修改的地面自动验证系统，将待修改的程序自动分割成符合在轨注入要求的程序块，将程序块注入星载计算机后，再从星载计算机的内存中下卸程序块，最后将下卸的修改程序内容与待修改的程序块进行比对，由此来验证注入过程中程序修改的正确性，这种方法大大提高了程序修改验证的效率和可靠性，为海洋二号卫星在轨抢救工作提供了有力的地面支持，卫星在轨抢救节省了宝贵时间，提供的程序修改块100%正确。