本发明公开了一种生物相容性强荧光金银混合团簇及其制备方法，其中金银混合团簇的结构由以下通式(1)或通式(2)表达:[AuxAg25-x(R23)10(Rl)5M2]…………(1)，[AuxAg25-x(R23)10(Rl)5M2]Lz…………(2)，其中x＝12-18，M为Br或Cl，Z为1或2。本发明金银混合团簇具有荧光量子产率高、荧光稳定性好、宽激发、生物相容性好的特点，具有确定的结构组成并可通过修饰配体增加水溶性，可用于细胞及生物组织成像应用中。