本发明涉及一种混合型储能变流装置及其运行控制方法，该储能变流装置将两种独立的储能介质—铅酸蓄电池和超级电容接入电路，确保铅酸蓄电池和超级电容的独立性，且储能变流装置的主电路采用AC/DC+DC/DC的两级变换拓扑结构，运行的可靠性较高，在储能装置启动运行时，铅酸蓄电池和超级电容进入混合工作模式，实现了电能的优势互补，当某个储能介质发生故障时，将该储能介质所在的回路断开，实现了对铅酸蓄电池和超级电容的协调控制，解决了现有储能装置无法满足大规模储能系统需求的技术问题。