本发明公开了一种含有生物碱类活性成分的海参提取物及其提取方法和应用。该海参提取物由如下方法提取得到：取海参粉加56℃蒸馏水搅拌；浸出液经离心，弃沉渣；上清液过滤膜过滤，滤液经超滤膜超滤；超滤外液经纳滤膜浓缩，得纳滤浓缩内液；浓缩液经旋转蒸发再浓缩；将其过大孔树脂柱；蒸馏水洗脱，弃洗脱峰；再经30%乙醇洗脱，取洗脱峰；蒸发浓缩后，过DA25阴离子柱层析，取活性成分峰，冷冻干燥；得含有H2a、H2b、H2c、H2d、H2e五个生物碱类活性成分的冻干粉。实验证明本发明的海参提取物及所含的生物碱类化合物有治疗贫血、免疫功能低下、创伤及疲劳的恢复、放化疗后的免疫修复等潜在用途。