本发明提供了一种微网协调控制系统，微网协调控制系统的微网协调控制器通过以太网分别与分布式电源终端、微网保护测控装置、智能电能表和微网能量管理系统相连；电能质量监测装置通过电能质量监测主站与微网能量管理系统相连；微网协调控制器实时监测分布式电源终端，并将分布式电源监测信息发送至微网能量管理系统；微网协调控制器接收微网能量管理系统发送的控制指令并向分布式电源终端和微网保护测控装置发送执行指令，实现微网优化运行。和现有技术相比，本发明提供的微网协调控制系统实现了接入多种分布式电源微网的运行免维护和实用化。