一种医用流体恒温控制器，该恒温控制器通过带有蠕动泵的导管与输液针相连，该恒温控制器包括通过流体通道串联连通的恒温加热系统和恒温冷冻系统，恒温加热系统包括恒温加热箱、第一盒体和保温层，第一盒体的底部设有加热元件和恒温加热控制器，恒温加热控制器的一端与加热元件相连接，另一端与电源插座相连接；恒温冷冻系统包括恒温冷冻箱、第二盒体和保温层，第二盒体的底部设有冷冻装置和恒温冷冻控制器，恒温冷冻控制器的一端与冷冻装置相连接，另一端与电源插座相连接；恒温加热控制器和恒温冷冻控制器均与外设的键盘和温度显示仪连接。本发明可广泛用于对温度的高低有不同要求的医用流体管路上，能在不同的环境温度下进行恒温使用。