一种用病死畜禽生产生物有机肥的方法，以病死畜禽为主要原料，将原料运至化制场，集中堆放在原料区；用绞碎机对原料进行切绞碎处理；在绞碎的物料中，添加功能性生物发酵菌剂进行软化；软化后的物料被送至高温蒸煮设备进行高温处理，制成粗料；将粗料送至翻炒搅拌机进行翻炒；翻炒后的物料经过油骨分离机后产出油、油渣和肉骨粉半成品；生物有机肥生产过程包括预处理；调质；接种；发酵；干燥脱水；粉碎筛分。本发明将病死畜禽尸体、动物加工废弃物，经高温蒸煮和高温好氧发酵两步无害化处理后转变为安全优质的生物有机肥，处理工艺简单，成本低，不产生二次污染，可有效消除病死畜禽对环境的污染，还可以获得安全优质的生物有机肥。