本发明涉及了一种含有微生物溶菌酶的饲料添加剂、药物及其用途，通过把溶菌酶与复合油脂、中药组合物结合使用，并且控制溶菌酶的用量，对饲料中的添加量作相应的调整，通过三者的协同作用，利用溶菌酶具有的良好的抗菌杀菌效果，复合油脂、中药组合物对于机体的免疫调节、自由基调节和辅助作用，从内而外调整机体，能够有效对抗炎症、感染、增强自身抵抗力、抗病性，对抗生素已产生耐药性的菌株也有很强的杀灭作用，保证动物的肠道的健康，防治动物下痢，提高动物生产性能。使用本方法疗效好、安全性高，成本低廉，无耐药性、无药物残留、无毒副作用、是绿色环保的活性物质。