本发明提供一种远程集中控制10G EPON设备的方法及其系统，所述方法包括：（1）预设看门狗属性；（2）通信管理系统TMS查询10G EPON设备看门狗机制状态；（3）更改设备看门狗机制时，TMS向EMS发送看门狗机制信息；（4）EMS向10G EPON设备发送看门狗机制信息；（5）10G EPON设备切换所需看门狗机制；（6）通过EMS通知TMS设置成功。所述系统包括通信管理系统TMS、网络接入设备管理系统EMS、10GEPON设备和看门狗；所述通信管理系统TMS、网络接入设备管理系统EMS和10GEPON设备依次连接。本发明在于设计了多层次多进程喂狗程序，并设计了分层识别进程运行状态，可根据用户需求，更换看门狗机制监控的进程，避免传统看门狗机制监控所有进程致使设备因用户不需要的功能故障而重启，提高系统稳定性。