本发明公开了一种猪流行性腹泻病毒的荧光定量PCR引物和探针，其中上、下游引物如SEQ ID NO:1~2所示，探针P1：SEQ ID NO:3，探针P2：SEQ ID NO:4，且探针1和探针2序列的3’端结合荧光淬灭基团，探针P1和探针P2序列的5’端结合不同的荧光报告基团。该引物特异性和灵敏度都较高，且能够检测出变异的PEDV，可以对各种临床样品进行检测、鉴别，从而可以快捷地对流行的PEDV毒株进行区分，操作简单、实用。