本发明涉及治疗腹泻的药物组合物及其制备方法和用途。具体而言，本发明涉及一种治疗腹泻的药物组合物，其由香薷挥发油、忍冬叶乙醇-水提取物、金樱根水提取物和茯苓水提取物组成，以生药重量份计，香薷为5-167份、忍冬叶为2.5-80份、金樱根为4.2-80份和茯苓为2.5-100份。该药物组合物可用于治疗哺乳动物腹泻，无明显的毒副作用。本发明还涉及该药物组合物的制备方法，以及一种治疗腹泻的药物制剂，其包括治疗有效量的本发明的药物组合物作为活性成分以及一种或多种药学上可接受的载体。