本发明属于家畜分子标记制备技术领域，具体涉及一种作为猪标记辅助选择应用于猪腹泻抗性性状相关的分子标记的检测及应用。所述的分子标记由基因克隆得到，它的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO：1所述。在序列表SEQ ID NO：1的第625bp处有一个G/T的碱基突变，导致PCR-RFLP-BshN1多态性。本发明还公开了扩增基因DNA序列所用的引物以及用于多态性的检测方法。本发明为猪腹泻抗性性状标记辅助选择提供了新的分子标记。