本发明公开了一种用于制冷设备的多温区单独控制系统及控温方法，其包括压缩机与多个用于布置在对应温区内的蒸发器，其中，所述压缩机的回液端分别与多个蒸发器的回液端相连接，多个蒸发器采用并联方式布置，多个蒸发器的进液端均与一冷凝器相连接，所述冷凝器与所述压缩机的出液端相连接。采用一个压缩机与多个蒸发器并联的布局方式，即能够单独控制对应温区的温度，又降低了控制系统占用的空间，节省压缩机数量，本发明的电磁阀设置在每路的蒸发器回液端，当某一路单独拉温时，通过电磁阀阻断另外一路的蒸发器的出口，避免了因为压差而导致制冷剂进入需要拉温的这一路，同时通过控制电磁阀阻断蒸发器出口，可以使这一蒸发器达到储液的目的。