本发明公开了一种MERS-CoV病毒膜蛋白中的RBD片段及其编码基因和应用。1、一种蛋白质，为如下（a）或（b）或（c）或（d）：（a）序列表的序列1自N末端第4至243位氨基酸残基组成的蛋白质；（b）序列表的序列1自N末端第1至243位氨基酸残基组成的蛋白质；（c）序列表的序列1自N末端第4至249位氨基酸残基组成的蛋白质；（d）序列表的序列1所示的蛋白质。发现MERS-CoV可能有一个潜在的受体结合域(Receptor Binding Domain,RBD)，对RBD进行深入研究有助于发现阻断该病毒入侵的关键靶点，对于该病毒的治疗药物和预防疫苗的研发具有重要的理论参考价值。