一种变电站二次回路无线核相带负荷校保护的方法及系统，该方法包括采用GPS或BD对时装置实现装置的精确对时；采用DSP实现对所采集的电流、电压信号的幅值、相角以及每个采样点时标的处理分析；根据已测二次回路电流电压幅值、相角、时标、频率，推算模拟与被测二次回路相同的电流电压信号，实现对被测二次回路电流电压信号的离线模拟拟合；进行数据分析处理，实现保护装置二次回路的核相与校保护；本发明不仅适用于常规变电站的送电调试而且适用于智能变电站的送电调试，有效解决了输配电系统常规变电站和智能变电站送电调试过程中核相、带负荷校保护时施放很长试验线的不方便以及由于施放长试验线给送电带来的安全隐患与风险。