本发明提供一种基于风能发电的电能质量补偿控制装置与方法，装置包括风电转换模块、中央控制模块、直流处理模块、交流电压互感模块、H桥逆变模块和旁路晶闸管模块，中央控制模块通过直流处理模块测量直流电的电流值和电压值，并计算直流处理模块的实时输出功率，对直流处理模块进行最大功率追踪，通过交流互感模块测量交流电网的电压值，当中央控制模块检测到交流电网的电压值低于所述交流电网预设的额定电压值的预设范围时，控制旁路晶闸管模块关断，并控制H桥逆变模块向交流电网补偿交流电网预设的额定电压值与交流电网电压值的差额电压值。本发明基于风能发电的电能质量补偿控制装置没有采用串联变压器，因而体积小、成本低廉。