本发明涉及一种核桃壳过滤器清洗系统，其连接至一待清洗核桃壳过滤器上，其包括清洗水罐以及循环泵；其中，所述清洗水罐顶部和待清洗核桃壳过滤器通过一回流管道连接；该清洗水罐顶部连接一化学药剂加入管，底部连接一污水排放管；所述循环泵一端连接清洗水罐，另一端通过一进水管道和待清洗核桃壳过滤器连接；于所述回流管道和进水管道之间通过一反冲洗管道连接，于反冲洗管道上设有一反冲洗流量调节阀。本发明的核桃壳过滤器清洗系统对核桃壳过滤器进行充分的反洗，并辅助适当的热力清洗和化学清洗，能大大提高实际的清洗效果，并使部分已板结的滤料回复活性。