本发明涉及一种尼龙66/凹凸棒土纳米复合纤维的制备方法，包括（1）将经过KH550表面改性的凹凸棒土与尼龙66盐混合分散；（2）通过原位聚合的方法，制得高凹凸棒土含量的尼龙66切片；（3）将该高凹凸棒土含量的尼龙66切片与纯尼龙66切片熔融共混，制得纺丝切片；（4）将尼龙66/凹凸棒土复合纺丝切片真空干燥；（5）通过熔融纺丝及后牵伸，制得尼龙66/凹凸棒土纳米复合纤维。本发明提供的制备方法可以提高尼龙66切片的结晶速度，所制备的纳米复合纤维的力学性能更优。