本发明提供了一种电力变压器消磁的方法及系统，在对电力变压器直阻测试后，由电力变压器的饱和磁通和骨架绕线系数，得到电力变压器的剩磁通，然后由剩磁通的大小和极性进而获得剩磁通的反向磁通，通过向电力变压器加该反向磁通，利用反向磁通中的暂态磁通与剩磁通的方向相反的特性，达到对剩磁通消磁的目的。本发明采用先对电力变压器中的剩磁通的大小和极性进行估算，然后再加反向磁通的技术手段，实现了对剩磁通的有效消磁，消磁效果明显，解决了现有技术中的难题。