本发明涉及一种基于短时开放保护的变压器死区故障继电保护方法。该方法在变压器某侧死区故障的跳闸控制中，设定以下条件：条件一，变压器该侧后备保护跳闸出口继电器处于动作状态或其他电气量保护跳闸出口继电器处于动作状态；条件二，当条件一满足时，启动一次脉冲T时间开放保护；条件三，变压器该侧A相或B相或C相电流达到启动值，或零序电流或负序电流达到启动值。当上述条件满足时，延时后启动变压器差动保护跳闸总出口回路，启动跳开变压器的各侧断路器；当上述任一条件不满足时或开放保护满时间T后，0s返回，断开启动变压器差动保护跳闸总出口回路。本发明动作原理简单、可靠性高、能够快速切除变压器各侧各种电压等级死区故障。