本发明公开了一种吹塑用聚酯弹性体及其制备方法，按重量百分数计，包括：热塑性聚酯弹性体88.0~96.9%；聚酯液晶高分子化合物3.0~10.0%；异氰脲酸酯化合物0.1~2.0%。其制备方法是先通过酯化反应或酯交换反应、缩聚反应得到热塑性聚酯弹性体，然后加入聚酯液晶高分子化合物和异氰脲酸酯化合物进行反应，即得。本发明通过在热塑性聚酯弹性体中加入聚酯液晶高分子化合物和异氰脲酸酯化合物，得到的吹塑用聚酯弹性体的熔融指数在0.5-1.5之间，具有较高的熔体强度，产品外观质量更好，且加工过程也比较容易，具备优异的力学性能。