本发明公开了一种放射源定位方法、装置及系统。该方法包括：根据模拟数据获取探测器的晶体阵列中晶体计数比与放射源角度的关系；测量待测放射源放射射线时所述晶体阵列的实测晶体计数；在计数噪声的变化范围内，根据所述实测晶体计数以及各所述计数噪声获取多个去噪晶体计数比，根据所述晶体计数比与放射源角度的关系获取与各所述去噪晶体计数比相对应的各实测放射源角度，并选取计数噪声最优时的实测放射源角度为所述待测放射源的放射源角度。该装置包括：处理模块、测量模块和计算模块。该系统包括：放射源定位装置、待测放射源和探测器。本发明采用晶体计数比作为计算参数，采用有效的扣除噪声技术，提高了放射源定位的灵敏度和准确度。