本发明公开一种不同辣椒品种间作缓解连作障碍和控制病虫害的种植方法，属于农业种植技术领域。本发明通过将生长高度、抗病、抗虫性不同的辣椒间作；所选辣椒品种存在生长高度差异，依照辣椒的生长高度依次循环间作；地块畦面宽170cm，沟宽30cm、深25cm；每畦六行，行距34cm，穴距25-30cm；每畦间作不同品种的辣椒。所述种植方法提高了辣椒的产量和品质。不同辣椒品种间作栽培可有效地缓解辣椒连作障碍，实现辣椒常年连续种植，提高土地利用率，节约土地资源。同时使辣椒疫病的防治效果达76～89%，辣椒烟青虫的防治效果达73～91%，确保辣椒生产质量安全和农业生态环境安全，达到增效、增产和增收的目的。