本发明提供一种高效表达α-转移葡萄糖苷酶的黑曲霉菌株，其保藏编号为CGMCC No.8469。本发明通过紫外诱变的方法获得的突变菌株黑曲霉Atm61能高效重组表达α-转移葡萄糖苷酶，其发酵酶活高达14952U/mL，比出发菌提高了58%。该突变菌株黑曲霉Atm61表达的α-转移葡萄糖苷酶，可广泛应用于低聚异麦芽糖浆的生产，能使转苷效率提高40%～50%以上，获得的异麦芽糖浆中异麦芽低聚糖的质量体积比高达90%，市场前景广阔。