本发明公开了一种生产鱼皮胶原蛋白的方法，它是将冻干的鱼手工剥下鱼皮，或手工分割的鲜鱼皮低温烘干或冻干，鱼皮的水份保持在10-15%，经捶打、揉搓、剪切，鱼肉、鱼鳞、鱼骨等破碎，与鱼皮分离，再风选，变得膨松、色白、柔软；起到了去杂、脱色和脱腥作用，90℃热提取，lcalase2.4L和Neutrase0.8L酶解，脱色除味，5微米孔径滤膜过滤，灭菌、浓缩、喷雾干燥，得到的胶原蛋白，其分子量在1000Da以下多肽含量为93.7%，得率提高40%，还提供了鱼皮精制分离机，为生产的鱼皮胶原蛋白优质纯正的原料，解决了不能规模化、产业化生产的瓶颈问题。