本发明公开了一种智能变电站站控层测试的方法，包括下列步骤：（1）通过模式匹配模块依据间隔层智能电子设备的模型文件从运行模式库中匹配出所述智能电子设备的运行模式与测试模式，并将所述运行模式与测试模式信息存入模式存储器，同时通知仿真设备运行模块、测试管理与控制模块；（2）仿真设备运行模块通过加载所述运行模式构建符合IEC 61850通信规范的仿真设备；（3）测试管理与控制模块通过加载测试模式实现站控层仿真设备测试数据的标准化输出，并生成相应的测试报告。本发明的智能变电站站控层应用系统测试的方法，可以大大简化人工核对工作量且测试过程的规范性、测试结果的正确性均得到有力保证。