本发明的建立医学数字标本三维演示系统的方法包括如下步骤：A）拍摄标本数字照片；B）照片处理；C）动画文件制作；D）文本文件制作；E）程序编写；F）装配；G）测试。特别地，为了建立可以在网站浏览的医学数字标本三维演示系统，还包括在C）和D）将动画文件和文本文件制作成网页文件；在F）之后上传至网站。应用本发明的方法可以建立医学数字标本三维演示系统，包括在电脑上演示的单机版演示系统以及在网站上浏览的网络版演示系统，解决了目前教学平面化，没有实物，不直观等问题，实现了优势教学资源共享。