本发明公开了一种烟草育苗基质的配方及其制备方法，该烟草育苗基质的配方包括：秸秆粉末、羊粪、碱解氮、有效磷、有效钾、红砂土、蛭石；该烟草育苗基质的制备方法包括：将废弃的秸秆放入专用粉碎机，在高速旋锤片打击和筛板磨擦作用下被粉碎研磨，将秸秆粉末放置在容器内；称取碱解氮、有效磷、有效钾的重量，混合后添加到秸秆粉末中；将废弃的羊粪放入秸秆垫料堆沤进行发酵，并添加松土剂；分别称取红砂土和蛭石，添加到发酵有机肥料中；秸秆粉末与无机肥料混合物、红砂土、蛭石与发酵有机肥料混合物加入到搅拌机进行搅拌均匀；加入营养混合液，包装，放入仓库存储。本发明节省了资源，保护了环境，降低了生产成本，提高了营养价值。