本发明涉及一种用于电工钢连续铁损测量的信号同步控制系统及方法，该系统包括：信号隔离放大器，其接收和隔离厚度信号、张力信号和温度信号；信号同步模块，其接收增量编码器信号和焊点信号，并进行同步处理，获得长度信号；多路模数转换器，其将接收的厚度信号、张力信号、温度信号、长度信号及电工钢信号转换成数字量；微处理器，其根据接收的多路数字量，计算出信号源调节信号、厚度偏差信号、速度信号和厚度信号，并同时计算出磁感信号或比总损耗信号，再将计算出的信号传输给所述多路数模转换器；多路数模转换器，用于将微处理器计算出的信号转换成模拟量输出。本发明较大地提高了电工钢连续铁损在线测量的可靠性。