本发明公开了一种以重金属污染底泥于石漠化地表构建耕作层土壤的方法，包括如下步骤：1）将待整治石漠化地地表的石块进行破碎，平整地面；2）将河沙均匀平铺于平整后的地面上；3）将重金属污染底泥平铺于河沙上；4）将稳定剂撒于重金属污染底泥上；5）第一次旋耕；6）干湿交替处理15天，暴晒7天，进行第二次旋耕，旋耕方向和第二次相反；待旋耕后底泥、河沙、稳定剂的混合物质量含水率自然降低到25～30%，进行第三次旋耕，旋耕方向与第二次垂直；7）第三次旋耕后种植豆科绿肥1茬，进行第四次旋耕将绿肥还田，2个月后得到耕作层土壤。本方法得到的耕作层土壤重金属稳定化效果明显，种植的蔬菜作物重金属含量符合国家标准。