本发明公开了一种基于重叠网的分布式路由抗毁策略配置方法及系统，所述方法为：步骤101）提取网络信息；步骤102）将提取的信息发送给智能节点，智能节点对提取的信息进行处理和分析，并根据网络的链路和节点的运行状态及设备的业务状态信息生成路由策略；步骤103）通过智能节点将路由策略动态分发给域内相关的节点路由设备，同时智能节点之间相互通信进行路由策略信息的交互，用于保证逻辑域之间的联动，实现路由抗毁系统对全网的稳定性的保障；其中，所述网络信息包含：网络所承载的业务流信及路由设备性能状态信息。所述步骤101）具体为：由智能节点利用SNMP协议对网络相关信息进行采集，所采集的信息包含所承载的业务流信息及路由设备性能状态信息。