本发明提供一种基于指标预测的自动建模系统，包括：数据加载和存储模块，用于加载数据与存储后续流程完成后产生的结果数据；核心算法模块，具有算法库，所述核心算法模块运行所述算法库中的各个算法族的脚本，获取所述各个算法族中的最优参数；模型评估/整合模块，根据所述核心算法模块中获取的最优参数，获取最优算法或集成算法；企业应用模块，运行所述模型评估/整合模块所获得的所述最优算法或集成算法，并标准化运行结果后输出所述结果数据；配置模块，用于控制和驱动所述数据加载和存储模块、所述核心算法模块、所述模型评估/整合模块和所述企业应用模块的运行。本发明还提供一种基于指标预测的自动建模和部署的处理方法。