本发明涉及一种基于分布式电源接入的智能变电站负荷自动分配方法，其包括以下步骤：建立分布式电源的数学模型，包括建立风力发电机组的数学模型、光伏电池的数学模型和稳定性分布式电源的数学模型；根据当前分布式电源接入配电网的智能变电站所采集的网络及负荷数据进行全网的潮流计算，在给定约束条件下，建立分布式电源接入配电网的无功优化模型和网络重构模型；智能变电站负荷自动分配系统中的迭代计算模块将分布式电源接入配电网的无功优化模型和网络重构模型的两个子问题交叉迭代，逐步逼近最优解，完成分布式电源接入配电网的智能变电站负荷自动分配。本发明可以广泛应用于智能变电站的负荷自动分配过程中。