本发明公开了一种质子交换膜燃料电池金属双极板防护涂层的制备方法，包括（1）将Fe-Cr丝焊接到金属双极板表面作为电极引线；（2）将配制的LiCl-KCl-Li3N-CrCl2混盐干燥；（3）将混盐于高温井式炉中熔融，将金属双极板作为阴极，Cr作为阳极，在金属双极板表面电沉积Cr涂层；（4）转换电沉积的阴阳极，使金属双极板上的Cr涂层阳极氮化，部分转化为CrxN涂层，x为1或2，在金属双极板表面得到Cr/CrxN复合涂层。本发明的制备方法工艺简单、对环境友好、可有效控制防护涂层厚度及其微观结构，制备的防护涂层具有优异的耐腐蚀性，且与双极板基体结合良好。