本发明公开了一种基于磁性纳米粒子和量子点的核酸传感器，将磁性纳米粒子Fe3O4@SiO2@AuNPs的DNA探针，与目标核酸分子和基于量子点的DNA探针，构建夹心型荧光检测体系，利用外加磁场将磁性纳米粒子从检测体系中分离，测上清液中各量子点的荧光残留。可根据加入的目标核酸分子的浓度与检测体系的荧光强度的改变量绘制浓度-响应曲线，实现多种目标核酸分子的同时检测，检测下限达皮摩尔级（pM）。利用量子点宽激发窄发射的特性，可实现单一激发波长下多种量子点的同时发光，即可将多种目标核酸分子的浓度-响应曲线展示在同一光谱图中。本发明操作简单，检测灵敏度高，可靠性好，在肿瘤早期诊断中有广泛的应用前景。