本发明涉及一种全空间原位氮磷拦截水生态修复方法，包括如下步骤：（1）单元生物膜载体结构的设置（2）生物膜载体的固定（3）控制污染源排放口或雨水径流污染源汇入水体的角度；（4）生态浮床的设置。本发明采用生态浮床技术组合生物膜技术，将生物膜载体设置为半封闭式篮筐结构，改善了原位挂膜效果，挂膜速度快，效果好，结合水流交汇区污染物输移扩散特性，对生态浮床和生物膜的布置进行优化，达到对污染水体重点污染源和污染区进行原位氮磷拦截和处理。对环境温度变化和水体流速变化适应性强，氮磷去除效果好，可应用于城市内河水域氮磷拦截和治理。