本发明公开了一种聚甲基丙烯酸填充咪唑微囊-磺化聚醚醚酮复合膜及制备。所述的复合膜由聚甲基丙烯酸填充咪唑微囊和磺化聚醚醚酮组成。其制备步骤包括：磺化聚醚醚酮的制备；以甲基丙烯酸为单体，偶氮二异丁腈为引发剂；采用沉淀共蒸馏方法，以1-乙烯基咪唑为单体，二甲基丙烯酸乙二醇酯为交联剂，合成聚甲基丙烯酸填充咪唑微囊；将微囊分散到N,N-二甲基甲酰胺中，与磺化聚醚醚酮混合形成铸膜液，经制膜得到该复合膜。本发明具有制备过程简便、可控性强等优点，制得的杂化膜用于直接甲醇燃料电池质子交换膜，在饱和湿度下表现出较高的质子传导率，在低湿度条件质子传导性能依然保持稳定。