一种含藻废水高效复合式净化方法，其特征在于，所述净化方法包括如下步骤：(1)、首先将含藻废水经过滤室过滤以去除大部分悬浮物和部分藻类；(2)、再将过滤所得水体进入等离子体反应室，向等离子体反应室中通入空气并通过等离子体反应室内的针-板式反应器对水体氧化灭藻；(3)、将氧化灭藻后的水体进入絮凝室絮凝；形成可分离的絮凝物；所述絮凝物与水体中的气泡结合为比重小于水的气浮体浮至水面，凝聚成浮渣；去除浮渣，即得净化的水体。本发明方法除藻效率高、药剂使用量小、出水水质好；采用等离子体放电氧化除藻，大大降低了恶臭气体的散发，降低了恶臭气体对大气环境的污染，该系统不仅具有高效除藻率，而且对于SS、CODCr也有较好的去除效果。